MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 18579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016587	CCA	2	6	642223	642228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006799
18502	NC_016587	CAG	2	6	642239	642244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006799
18503	NC_016587	AGGC	2	8	642291	642298	25 %	0 %	50 %	25 %	375006799
18504	NC_016587	CCG	2	6	642301	642306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006799
18505	NC_016587	CGA	2	6	642328	642333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006799
18506	NC_016587	TCC	2	6	642456	642461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18507	NC_016587	ACG	2	6	642483	642488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_016587	C	6	6	642514	642519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18509	NC_016587	CCGG	2	8	642565	642572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18510	NC_016587	GGTC	2	8	642715	642722	0 %	25 %	50 %	25 %	375006800
18511	NC_016587	TTC	2	6	642726	642731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006800
18512	NC_016587	CGAC	2	8	642832	642839	25 %	0 %	25 %	50 %	375006800
18513	NC_016587	CCGAC	2	10	642910	642919	20 %	0 %	20 %	60 %	375006800
18514	NC_016587	TCG	3	9	642985	642993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006800
18515	NC_016587	TCG	2	6	643015	643020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006800
18516	NC_016587	CCG	2	6	643027	643032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006800
18517	NC_016587	GCG	2	6	643033	643038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006800
18518	NC_016587	GCT	2	6	643058	643063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006800
18519	NC_016587	GCC	2	6	643077	643082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006800
18520	NC_016587	CGC	2	6	643091	643096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006800
18521	NC_016587	TCG	2	6	643165	643170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006800
18522	NC_016587	CCGG	2	8	643230	643237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18523	NC_016587	C	6	6	643244	643249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18524	NC_016587	CGG	2	6	643256	643261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18525	NC_016587	TCA	2	6	643266	643271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18526	NC_016587	GCCG	2	8	643282	643289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18527	NC_016587	CAA	2	6	643297	643302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18528	NC_016587	GCCC	2	8	643330	643337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18529	NC_016587	CGT	2	6	643349	643354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18530	NC_016587	CG	3	6	643390	643395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18531	NC_016587	GGA	2	6	643439	643444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_016587	CCCG	2	8	643486	643493	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18533	NC_016587	CCA	2	6	643514	643519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18534	NC_016587	CCG	2	6	643535	643540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18535	NC_016587	GTCGC	2	10	643662	643671	0 %	20 %	40 %	40 %	375006801
18536	NC_016587	GAC	2	6	643674	643679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18537	NC_016587	CTG	2	6	643707	643712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18538	NC_016587	CGCC	2	8	643766	643773	0 %	0 %	25 %	75 %	375006801
18539	NC_016587	CCT	2	6	643777	643782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006801
18540	NC_016587	GCT	2	6	643868	643873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18541	NC_016587	CGG	2	6	643880	643885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18542	NC_016587	GAG	2	6	643905	643910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006801
18543	NC_016587	CTG	2	6	643911	643916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18544	NC_016587	CGT	2	6	643991	643996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18545	NC_016587	TGA	2	6	644011	644016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006801
18546	NC_016587	GC	3	6	644017	644022	0 %	0 %	50 %	50 %	375006801
18547	NC_016587	GC	3	6	644056	644061	0 %	0 %	50 %	50 %	375006801
18548	NC_016587	CAG	2	6	644067	644072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18549	NC_016587	AGC	2	6	644080	644085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18550	NC_016587	TCG	2	6	644161	644166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18551	NC_016587	CGC	2	6	644195	644200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006801
18552	NC_016587	CGG	3	9	644243	644251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18553	NC_016587	CGGC	2	8	644254	644261	0 %	0 %	50 %	50 %	375006801
18554	NC_016587	GCC	2	6	644268	644273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006801
18555	NC_016587	CGC	2	6	644279	644284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006801
18556	NC_016587	CGG	2	6	644324	644329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18557	NC_016587	AGC	2	6	644410	644415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006801
18558	NC_016587	TGA	2	6	644440	644445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006801
18559	NC_016587	ACCGCC	2	12	644454	644465	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375006801
18560	NC_016587	GCG	2	6	644515	644520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18561	NC_016587	GTG	2	6	644541	644546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006801
18562	NC_016587	CAA	2	6	644603	644608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375006801
18563	NC_016587	CGG	3	9	644672	644680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18564	NC_016587	GGC	2	6	644696	644701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18565	NC_016587	CAGC	2	8	644750	644757	25 %	0 %	25 %	50 %	375006801
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18567	NC_016587	ACC	2	6	644829	644834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006801
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18569	NC_016587	GGT	2	6	644858	644863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006801
18570	NC_016587	GCG	2	6	644890	644895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
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18572	NC_016587	CGC	2	6	645041	645046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006801
18573	NC_016587	GCGAC	2	10	645049	645058	20 %	0 %	40 %	40 %	375006801
18574	NC_016587	CGC	2	6	645116	645121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006801
18575	NC_016587	ACC	2	6	645127	645132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006801
18576	NC_016587	TGCC	2	8	645145	645152	0 %	25 %	25 %	50 %	375006801
18577	NC_016587	CGG	2	6	645178	645183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006801
18578	NC_016587	CCCT	2	8	645223	645230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18579	NC_016587	TGG	2	6	645247	645252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.